实际上成为科学忍具这个组织领导者的上原，开始制定相关章程。
首先是选择一个基地，星忍村作为秘密基地不适合暴露，上原把目光投向草之国，那个已废弃的鬼灯城。
随着极乐之箱和悟被终结，鬼灯城被打成废墟，这里近乎被草忍村淡忘了。
于是，由蝎和上原出面，代表岩隐村和砂隐村通一起同草忍村协商，希望他们让出已经毫无用处的鬼灯城。
弱小的草忍村很识趣，他们很清楚不管是砂隐还是岩隐，想要占据孤悬在外的鬼灯城都很轻松。草忍村拿了一大笔钱之后，再交给大名一部分，草忍不仅把鬼灯城交付给上原，还把鬼灯城从草之国地图上划了出去。
随后，上原寄存在日向汢那里的几万平民入驻鬼灯城，各项重建工作如火如荼的进行着，这里将是隶属于科学忍具组织共有的基地。
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